L'épisode commence où s'était terminé le season finale précédent. Lorelai se réveille dans le lit aux côtés de Christopher. Confuse, elle sort en urgence, ignorant les demandes de Christopher de rester. Une fois chez elle, elle se débarasse de tout ce qui lui rappelle Luke. Rory reçoit un jouet fusée de la part de Logan et se demande bien ce que cela signifie. Elle décide de le rejoindre à Londres pour l'été, et y apprend qu'il lui a acheté un billet pour qu'elle aille lui rendre visite à Noël. Par ailleurs, Kirk et Taylor causent un accident bizarre qui endommage le restaurant de Luke. Paris accepte d'aider une étudiante, Katilin, à étudier pour les SATs. Rory et Lorelai passeront du temps ensemble à un match de racquetball. Finalement, Luke se rend chez Lorelai pour lui demander de s'enfuir avec lui...

Rory est triste depuis que Logan est parti et surtout du fait qu'ils ont dû annuler leur voyage planifié depuis longtemps en Asie. Afin de redonner le moral à Rory et de se changer les idées vu le tournant qu'a pris dernièrement ses propres amours, Lorelai transforme sa maison sur le thème asiatique. Afin de réparer les dégâts causés au restaurant de Luke, T.J. arrive en ville, et Luke lui annonce sa séparation avec Lorelai. Lorsque cette dernière rencontre Luke en ville, ils ont une confrontation très douloureuse et Luke ne peut cacher sa colère à propos de leur récente rupture. Rory apprend avec tristesse que sa mère a couché avec Christopher et est furieuse. Par ailleurs, Lane et Zack rentrent de leur lune de miel à Mexico, chacun avec leur propre histoire d'horreur.

Quand Richard et Emily n'ont aucune réaction particulière à l'annonce de la séparation de leur fille et Luke, Lorelai réalise soudainement que, pour l'essentiel de sa vie sentimentale, elle a toujours fait ou ressenti les choses à l'opposé de la volonté de ses parents. Plus tard, quand Michel force Lorelai à assister au bal des débutants organisé par Emily, Lorelai découvre que certaines choses que ses parents ont voulu pour elle n'étaient en fait pas si terribles. Elle rencontre une enfant de 10 ans, nommée Charlotte, qui lui rappelle elle lorsqu'elle avait son âge et la fait réfléchir sur les choix qu'elle a fait dans sa vie. Par ailleurs, Rory a des difficultés à supporter sa relation à distance avec Logan. Enfin, après avoir sorti Rory pour un dîner père/fille, Christopher fait une effrayante révélation à Lorelai.

Lorelai et Christopher commencent à sortir ensemble, et même si Lorelai a du mal à s'impliquer complètement dans cette relation, Christopher organise un rendez-vous romantique pour gagner à nouveau son coeur... De retour à Yale, Rory rencontre deux étudiantes excentriques lors d'une exposition d'art, et Richard est invité pour une conférence. Luke a la charge d'April pour quelques semaines car Anna doit quitter la ville. Par ailleurs, Emily est arrêtée parce qu'il est illégal de parler au téléphone en conduisant dans le Connecticut et Lorelai est obligée de l'aider à sortir de prison.

Emily et Richard se réjouissent de voir Lorelai et Christopher se présenter au souper du vendredi soir ensemble. Christopher révèle que Sherry lui a envoyé une lettre disant combien elle regrettait d'avoir abandonné leur fille, GiGi et qu'elle voudrait que celle-ci lui rende visite à Paris. Lorelai n'arrive pas à croire que Chris puisse réellement accepter et elle se dispute avec lui pendant le dîner. Logan retourne en ville pour un voyage d'affaire et rend ainsi une visite surprise à Rory. Rory est très heureuse, mais durant le dîner avec les collègues de Logan, elle se rend compte qu'elle n'a aucun lien avec son nouveau monde, et se sent particulièrement menacée par une de ses nouvelles collègues. Par ailleurs, Stars Hollow est affectée par une terrible odeur lorsqu'un train avec une cargaison de cornichons déraille, et Taylor refuse de payer pour le nettoyage.

A la veille de la remise des diplômes de Rory, Emily et Richard organisent une fête et chantent même une chanson en son honneur. Lors de celle-ci, Lorelai et Christopher sont réunis pour la première fois depuis leur séparation, et ils sont tous deux soulagés de constater qu'ils peuvent toujours être amis. Logan surprend tout le monde lors de la soirée en demandant Rory en mariage, mais celle-ci est trop choquée pour lui donner une réponse et demande à Lorelai de l'aider à prendre une décision. Le jour de la remise des diplômes, Rory donne finalement sa réponse à Logan. Lorelai est embarassée à propos de la chanson qu'elle a interprété pour Luke lors du karaoké, et Luke est blessé quand il l'endant dire que ça ne signifiait rien.